ימעד אַפּפּס Web אַפּפּליקאַטיאָן באַניצער מאַנואַל

iMed באַניצער מאַנואַל

הקדמה

1.1. ציל
דער ציל פון דעם web אַפּלאַקיישאַן איז צו נעמען רוי אינפֿאָרמאַציע און לאָזן מאַניפּיאַלייטינג עס אין אַ שטייגער וואָס גיט רעזולטאַטן נוציק אין באַשלוס געמאכט. דאָס קען זיין צו באַן אַ מאָדעל מיט רוי דאַטן אָדער פּרידיקטינג די רעזולטאַט ניצן מאָדעלס און אַנאַליסיס.
1.2. נאַוויגאַציע מעניו
די נאַוויגאַציע מעניו אויף די שפּיץ פון די בלאַט כּולל אַלע די לינקס צו באַקומען צו ווו איר דאַרפֿן צו זיין. אויב איר אלץ פאַרפאַלן, איר קענט שטענדיק גיט די צוריק פייַל צו באַקומען צו אַ באַקאַנט בלאַט, גיין צוריק היים אָדער געפֿינען די בלאַט איר זוכט פֿאַר אין די נאַוויגאַציע מעניו.
1.3. חשבון
אויב איר טאָן ניט האָבן אַ חשבון, איר מוזן רעגיסטרירן צו נוצן די אַפּלאַקיישאַן. צו טאָן דאָס, גיט די חשבון קנעפּל אין די שפּיץ רעכט און גיט רעגיסטרירן. דערנאָך אַרייַן דיין נאמען, פּאַראָל און E- בריוו צו פאָרזעצן.

אויב איר שוין האָבן אַ חשבון, קלאָץ אין מיט דיין נאמען און פּאַראָל.

היים בלאַט

דורך געבן אַ קליק אויף די ייטאַמז אויף די לינקס פון די בלאַט, אַ באַשרייַבונג פון יעדער וועט דערשייַנען אין די מיטן פון די בלאַט צו העלפן איר פֿאַרשטיין וואָס יעדער איינער טוט.

iMedBot

די iMedBot אַפּלאַקיישאַן גיט אַ צובינד אַז פאַסטערז גרינג באַניצער ינטעראַקשאַן מיט אגענטן, וואָס אַלאַוז פערזענליכען פּראָגנאָז און מאָדעל טריינינג. עס סערוועס ווי דער ערשטער שריט צו יבערמאַכן די אַוטקאַמז פון טיף לערנען פאָרשונג אין אַן אָנליין געצייַג, וואָס האט די פּאָטענציעל צו אָנצינדן נאָך פאָרשונג פּערסוץ אין דעם פעלד. זיין ריספּעקטיוו באַניצער מאַנואַל קענען זיין געפֿונען דאָ.

דאַטאַ אַנאַליסיס

4.1. צוריקקריגן סובסעץ
דעם אָפּטיילונג לעץ דער באַניצער רעדאַגירן זייער דאַטאַסעט. איר קענען קלייַבן צו צופֿעליקער אַ נייַ דאַטאַסעט אָדער נוצן אַן יגזיסטינג איינער פון די קאַפּ-אַראָפּ מעניו.

אַמאָל די דאַטאַסעט איז ופּלאָאַדעד, איר קענען קלייַבן וואָס קאַמף איר וואָלט ווי צו נעמען דורך געבן אַ קליק איינער פון די אָפּציעס אויף די לינקס זייַט מעניו.
4.1.1. צוריקקריגן סובסעץ באזירט אויף פילטערס
דער אָפּטיילונג אַלאַוז איר צו באַקומען אַ קלענערער סאַבסעט פון דער אָריגינעל דאַטאַסעט באזירט אויף געגעבן פילטערס. קלייַבן די וואַלועס וואָס איר ווילט אין די סובסעט און דעמאָלט קלייַבן די שפאלטן וואָס איר ווילט געוויזן אין די לעצט דאַטאַסעט.

4.1.2. צוריקקומען סאָרטעד רעזולטאַטן
דעם קערט די דאַטאַסעט אין אַ סאָרטירט פאָרעם. קלייַבן די ציל זייַל, סאָרטינג סדר, נומער פון ראָוז צו צוריקקומען, און וואָס שפאלטן צו ווייַזן אין די לעצט רעזולטאַט.

4.1.3. יקספּאַנד די דאַטאַסעט
דאָס אַלאַוז דער באַניצער צו יקספּאַנד אַ מעשונעדיק זייַל סטאָרד ווי אַ ווערטערבוך אין אַ פאַקטיש טיש וואָס דער באַניצער קענען מאַניפּולירן. עס נעמט אַ נעסטעד דאַטאַסעט און באוועגט וואָס איז פארלאנגט דורך דער באַניצער אין די שפּיץ-מערסט שיכטע. ערשטער, צופֿעליקער אַ דאַטאַסעט וואָס כולל אַ זייַל מיט אַ נעסטעד דאַטאַסעט. אויב אַ זייַל וואָס דאַרף יקספּאַנדינג איז אויטאָמאַטיש דיטעקטאַד, קלייַבן וואָס זייַל צו יקספּאַנד און וואָס שפאלטן צו עקסטראַקט פון די נעסטעד אינפֿאָרמאַציע. דריקט פאָרלייגן און איר קענען view דיין אינפֿאָרמאַציע ווי שפאלטן פון אַ טיש אַנשטאָט פון נעסטעד דאַטן.
4.2. צונויפגיסן Files
דורך סאַלעקטינג און ופּלאָאַדינג קייפל דאַטאַסעץ דורך קטרל קליקינג (באַפֿעל פֿאַר מעק), דאָס וועט צונויפגיסן זיי אין איין גרעסערע דאַטאַסעט ווי צו נוצן פֿאַר עפּעס אַנדערש.

נאָר סעלעקטירן אַלע דאַטאַסעץ און פּלאָמבירן די פארלאנגט אינפֿאָרמאַציע. דאָס וועט ראַטעווען די נייַע דאַטאַסעט צו די iMed אַפּלאַקיישאַן און איז בארעכטיגט פֿאַר אראפקאפיע.
4.3. פּלאַנעווען פאַנגקשאַנז
דעם אָפּטיילונג לעץ דער באַניצער פּלאַנעווען זייער דאַטאַסעט. קלייַבן איינער פון די אָפּציעס אויף די לינקס זייַט מעניו און פּלאָמבירן די פארלאנגט פעלדער צו באַקומען דיין פּלאַנעווען. ונטער זענען די טייפּס פון פּלאַץ איר קענען מאַכן פֿון דיין דאַטן:

4.4. סטאַטיסטיש אַנאַליסיס
דער אָפּטיילונג לעץ אונדז לויפן סטאַטיסטיש טעסץ אויף אונדזער דאַטאַסעט. קלייַבן אַ פּראָבע צו לויפן פון די לינקס זייַט מעניו און פּלאָמבירן די פעלדער צו לויפן די טעסץ. ונטער זענען די טייפּס פון טעסץ וואָס זענען בנימצא:

ODPAC

5.1. לערן
דער בלאַט כולל אַ קורץ באַשרייַבונג פון יעדער טיפּ פון מיטל בנימצא אויף דעם בלאַט. קליקינג אויף די קנעפּל אין די שפּיץ פון יעדער אָפּטיילונג וועט לינק צו אן אנדער בלאַט אַלאַוינג דער באַניצער צו נוצן אָדער לערנען מער וועגן די טעמע.
5.1.1. עפּיסטאַסיס
דער בלאַט אַלאַוז אונדז צו נוצן MBS, אַ זוכן אַלגערידאַם צו לערנען פון דאַטן. ספּעציעל, עס אַלאַוז אונדז צו לערנען עפּיסטאַסיס, די ינטעראַקשאַן צווישן צוויי אָדער מער גענעס וואָס ווירקן די פענאָטיפּע. דאָס איז נוציק פֿאַר פּראָfile חולאתן אין די גענעטיק אַספּעקט. קאַנווענשאַנאַל מעטהאָדס זענען נישט פּאַסיק צו שעפּן די הויך-דימענשאַנאַל דאַטן געפֿונען אין גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד שטודיום (GWAS). די Multiple Beam Search (MBS) אַלגערידאַם אַלאַוז דיטעקטינג ינטעראַקטינג גענעס אין אַ פיל פאַסטער קורס. צופֿעליקער די דאַטן וואָס איר ווילט נוצן און אַרייַן די פארלאנגט פעלדער. פֿאַר מער אין-טיפקייַט אינפֿאָרמאַציע, געפֿינען די פול פּאַפּיר דאָ.

5.1.2. ריזיקירן סיבות
דער בלאַט לעץ אונדז נוצן די IGain פּעקל צו לערנען ינטעראַקשאַנז צווישן דאַטן. עס ספּאַסיפיקלי לערנט ינטעראַקשאַנז פון הויך-דימענשאַנאַל דאַטן ניצן אַ כיוריסטיק זוכן. דער אופֿן איז באזירט אויף די Exhaustive_IGain מעטאָד ביז אַהער דעוועלאָפּעד צו לערנען ינטעראַקשאַנז פֿון נידעריק-דימענשאַנאַל דאַטן. צופֿעליקער די דאַטן און אַרייַן די פארלאנגט פעלדער. מער אינפֿאָרמאַציע וועגן די IS טרעשאַלז און iGain קענען זיין געפֿונען דאָ.

5.1.3. פּראָגנאָז מאָדעלס
דער אָפּטיילונג אַלאַוז די נוצן פון פאָרויסזאָגן מאָדעלס שוין פאַר-געבויט אויף שפּיץ פון מאַשין לערנען מאָדעלס צו פאַרגיכערן די נוצן. דאָס אַלאַוז זייער נוצן אָן די נוצן פון קאָדירונג און פריערדיק דערפאַרונג צו פאָרויסזאָגן מאָדעלס ניצן זייער אייגענע דאַטאַסעט. עס זענען אַ נומער פון פּראָגנאָז מאָדעלס בנימצא צו דער באַניצער אַרייַנגערעכנט לאָגיסטיק, רעגרעססיאָן, שטיצן וועקטאָר מאַשינז (סוומס), באַשלוס ביימער, און פילע מער. די פול רשימה פון פּראָגנאָז מעטהאָדס זענען געפֿונען אויף די רעכט זייַט פון די בלאַט דאָ.
5.2. פּראָגנאָז
דער אָפּטיילונג אַלאַוז פֿאָרויסזאָגן פון אַ שערד מאָדעל ביז אַהער ופּלאָאַדעד. ערשטער צופֿעליקער אַ שערד מאָדעל אויב ניט שוין געטאן. דערנאָך קלייַבן די מאָדעל צו נוצן פֿאַר פּראָגנאָז דורך געבן אַ קליק דעם מאָדעל נאָמען. דערנאָך צופֿעליקער די דאַטן פֿאַר די פּראָגנאָז מאָדעל צו נוצן. דעם קענען זיין געטאן אָדער מאַניואַלי ניצן די פאָרעם אין די דנאָ פון די בלאַט אָדער ניצן די מוסטער בנימצא פֿאַר אראפקאפיע. אויב איר נוצן דעם מוסטער, צופֿעליקער די דאַטאַסעט file און גיט פאָרלייגן צו באַקומען די מאָדעל פּראָגנאָז.
5.3. באַשלוס שטיצן
באַשלוס שטיצן גיט קלאַסאַפאַקיישאַן און קענען פירן באַהאַנדלונג ברירות פון אינפֿאָרמאַציע סאַפּלייד צו די סיסטעם. עס איז טריינד פֿון דאַטן צו רעקאָמענדירן די אָפּטימאַל באַהאַנדלונג פּראָצעדור באזירט אויף די פֿעיִקייטן פון אַ פּאַציענט. מער אינפֿאָרמאַציע וועגן קליניש באַשלוס שטיצן סיסטעמען (CDSS) קענען זיין געפֿונען דאָ.
די סיסטעם רעקאָממענדאַטיאָן נעמט אַ פּאַציענט 'ס פֿעיִקייטן און רעקאַמענדז באַהאַנדלונג פּראָצעדור און פּרידיקס די צוקונפֿט מאַשמאָעס פון 5 יאָר מעטאַסטאַסיס. דער באַניצער ינטערווענטיאָן נעמט ביידע די פּאַציענט פֿעיִקייטן און די באַהאַנדלונג פּראָצעדור צו פאָרויסזאָגן די צוקונפֿט מאַשמאָעס פון 5 יאָר מעטאַסטאַסיס באזירט אויף קראַנט באַהאַנדלונג אַנשטאָט פון אָפּטימאַל באַהאַנדלונג.

MBIL

די מאַרקאָוו בלאַנקעט און ינטעראַקטיווע ריזיקירן פאַקטאָר לערנער (MBIL) איז אַן אַלגערידאַם וואָס לערנט איין און ינטעראַקטיוו ריזיקירן סיבות וואָס האָבן אַ דירעקט השפּעה אויף אַ פּאַציענט 'ס רעזולטאַט. דריקט "גיין צו MBIL" צו זיין רידערעקטיד צו די Python Package Index (PyPI) פֿאַר די MBIL פּעקל ליגן דאָ. מער אינפֿאָרמאַציע וועגן MBIL קענען זיין געפֿונען אין BMC Bioinformatics.

דאַטאַסעטס

דער אָפּטיילונג אַלאַוז דער באַניצער צו זען און ופּלאָאַד נייַ דאַטאַסעץ צו די web אַפּלאַקיישאַן.
7.1. זען אַלע דאַטאַסעטס בנימצא
צו זען אַלע דאַטאַסעץ בנימצא, פשוט גיט "ווייַזן בנימצא דאַטאַסעטס."

7.2. צופֿעליקער אַ דאַטאַסעט
צו ופּלאָאַד אַ דאַטאַסעט, גיט "ייַנטיילן דיין דאַטאַסעטס" און דעמאָלט פּלאָמבירן די פארלאנגט אינפֿאָרמאַציע ווי סטייטיד אויף די webבלאַט. ערשטער, צופֿעליקער די דאַטאַסעט און פּלאָמבירן די פארלאנגט פעלדער.

דערנאָך, פּלאָמבירן די פעלדער אונטן אָדער צופֿעליקער אַ טעקסט file מיט די אינפֿאָרמאַציע אָנגעפילט אין. אַן עקסampווי צו אָרגאַניזירן די אינפֿאָרמאַציע אַזוי די אַפּלאַקיישאַן קענען פֿאַרשטיין עס איז געגעבן אונטן.

מאָדעלס

דער אָפּטיילונג אַלאַוז דער באַניצער צו זען מאָדעלס בנימצא צו זיי און טיילן אַ מאָדעל.
8.1. זען אַלע מאָדעלס בנימצא
צו זען אַלע בנימצא מאָדעלס, גיט "ווייַזן בנימצא מאָדעלס."

8.2. ייַנטיילן אַ מאָדעל
צו טיילן אַ מאָדעל, דריקט אויף "ייַנטיילן דיין מאָדעלס" און דאַן צופֿעליקער אַ מאָדעל file טריינד דורך טענסאָר לויפן אָדער PyTorch.

8.2.1. פֿאַרבונדענע דאַטאַסעט
איר זאָל דעמאָלט ופּלאָאַד די פֿאַרבונדענע דאַטאַסעט וואָס כולל די כעדערז. די קלאַס / פירמע פֿאַר די דאַטאַסעט זאָל זיין אין די לעצטע זייַל.

8.2.2. פּרעדיקטאָרס און קלאַס אינפֿאָרמאַציע
אויב די דאַטאַסעט כולל אַלע די פֿעיִקייטן, די שטריך פאָרעם קענען זיין סקיפּט נאָך ופּלאָאַדינג די דאַטאַסעט. אָבער, אויב זיי זענען נישט אַלע אַרייַנגערעכנט, די אינפֿאָרמאַציע מוזן זיין צוגעשטעלט אין די באַשרייַבונג file אָדער אין די שטריך פאָרעם. קלייַבן די אָפּציע פון ​​די פאַלן אַראָפּ וואָס ינדיקייץ ווי איר בדעה צו צושטעלן די פּרידיקטערז און קלאַס אינפֿאָרמאַציע.

אויב איר נוצן די באַשרייַבונג אָפּציע, איר קענען פּלאָמבירן די פעלדער אָדער צופֿעליקער אַ טעקסט file מיט די אינפֿאָרמאַציע אָנגעפילט אין. אַן עקסampווי צו אָרגאַניזירן די אינפֿאָרמאַציע איז געגעבן אונטן.